Casada Edward O'Brien
em 2367 a bordo da USS Enterprise-D onde serviam juntos. Keiko deu à luz uma menina, Molly O'Brien, um ano depois. Molly nasceu
ainda quando estavam a bordo da Enterprise-D, quando em 2369 seu marido foi
nomeado chefe de operações da Estação Deep Space Nine onde se transferiram.
Keiko ficou decepcionada com as condições de vida na Estação, mas permaneceu lá por causa do carreira do
seu marido. Ela estava insatisfeita pela falta de oportunidades profissionais na estação para uma
botânica, e se preocupou com a falta de instalações educacionais para sua filha
e demais crianças da Estação. Keiko conseguiu uma permissão do então
Comandante Sisko para abrir um escola na Estação onde lecionaria até 2371, quando por
medo de um possível ataque de Dominion ficou sem alunos para lecionar. Logo
após ela aceitou uma missão como botânica principal em uma expedição no
planeta Bajor. A Missão manteve Keiko e a filha dela, Molly, longe da estação
e de seu marido. Em 2372, Keiko ficou grávida de sua segunda criança. Depois
de um sério acidente com o Explorador Volga, Dr. Bashir foi obrigado, para
salvar a vida de Keiko e sua filha, a remover esta de Keiko e implantar no corpo de Kira Nerys
para completar a gravidez. Em 2373, Kira entregou Kirayoshi O'Brien aos pais em uma
cerimônia de nascimento tradicional Bajoriana.
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